服務(wù)簡(jiǎn)介:
STR ( Short Tandem Repeat, 短串聯(lián)重復(fù)序列)基因分型技術(shù)是細(xì)胞身份鑒定最準(zhǔn)確有效的方法,被ATCC、ICLAC等權(quán)威機(jī)構(gòu)認(rèn)定為細(xì)胞鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)。STR基因位點(diǎn)由長(zhǎng)度為3~ 7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成,廣泛存在于人類基因組中,被稱為細(xì)胞的DNA指紋。通過(guò)對(duì)這些STR位點(diǎn)的檢測(cè),將檢查結(jié)果與專業(yè)的STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),從而確定被測(cè)細(xì)胞的真實(shí)身份,或判斷被測(cè)細(xì)胞是否與某些細(xì)胞,發(fā)生交叉污染。
人源細(xì)胞STR分型(cell line STR genotyping),是選用D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19個(gè)具有高度多態(tài)性基因座和一個(gè)性別基因位點(diǎn)Amelogenin對(duì)人源細(xì)胞進(jìn)行STR分型檢測(cè)。根據(jù)STR分型結(jié)果對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)狀態(tài)(是否存在交叉污染)和細(xì)胞的株系進(jìn)行確認(rèn)的技術(shù)手段。
內(nèi)容步驟:
1.確定STR位點(diǎn),設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案,包括熒光標(biāo)記的選擇,引物的設(shè)計(jì)、合成和標(biāo)記,熒光分子量?jī)?nèi)標(biāo)的選用等。
2.按照所設(shè)計(jì)的實(shí)驗(yàn)方案完成熒光PCR,利用瓊脂糖電泳檢測(cè)結(jié)果;若PCR產(chǎn)物特異性不夠,將進(jìn)行優(yōu)化。
3.PCR產(chǎn)物通過(guò)ABI 3730XL測(cè)序儀器進(jìn)行毛細(xì)管電泳檢測(cè),獲得擴(kuò)增片段大小的數(shù)據(jù)
4.用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等軟件對(duì)收集到的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理分析,將產(chǎn)物片段大小、數(shù)量多少的信息轉(zhuǎn)化成直觀準(zhǔn)確的波形圖譜,為下一步進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析或連鎖分析等遺傳分析提供可靠的數(shù)據(jù)。
服務(wù)內(nèi)容:
細(xì)胞收集,基因組DNA提取
熒光引物PCR擴(kuò)增21個(gè)str位點(diǎn)
產(chǎn)物經(jīng)測(cè)序儀電泳,獲得細(xì)胞基因分型結(jié)果
結(jié)果與ATCC、DSMZ、JCRB和RIKEN等細(xì)胞庫(kù)比對(duì)和分
樣品要求:
1. PCR產(chǎn)物或基因組DNA:濃度≥200ng/ul,總體積≥20ul,OD260/280在1.7至2.0之間;新鮮組織樣品:總量≥100mg的新鮮組織樣品或1~2ml血液樣品
2. PCR產(chǎn)物或基因組DNA請(qǐng)?zhí)峁悠返碾娪緳z測(cè)圖
3. 由于在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,可能會(huì)出現(xiàn)某些STR位點(diǎn)難以檢測(cè)的情況,建議提供3~4個(gè)備選STR位點(diǎn)
4. 建議使用6FAM, VIC, NED以及PET四種熒光標(biāo)記
5. 為盡量避免多種熒光信號(hào)的相互干擾,不建議同管檢測(cè)使用的熒光多于2種,多種熒光同管檢測(cè),PCR產(chǎn)物大小需相差50bp以上
6. STR檢測(cè)中常會(huì)出現(xiàn)一些比正常產(chǎn)物短2~4個(gè)堿基的峰,這是由截?cái)?/span>PCR造成的,屬于正常現(xiàn)象,并不會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析。
服務(wù)流程:
方案溝通 合同確認(rèn)
收到樣品
實(shí)驗(yàn)結(jié)果交付并反饋
實(shí)驗(yàn)結(jié)束
如何下單:
1 . 郵件咨詢下單:填寫(xiě)實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目的信息后,發(fā)送至郵箱[email protected]。
2 .在線咨詢下單:點(diǎn)擊屏幕右側(cè)“在線咨詢”,或掃描二維碼添加微信,或撥打咨詢電話15810756989,我們會(huì)盡快安排工作人員與您聯(lián)系!