項目介紹:
傳統(tǒng)的真菌分類鑒定主要依據(jù)是形態(tài)、生長及生理生化變化特征等特征。然而由于真菌種類繁,其生長形態(tài)、生理生化變化等隨環(huán)境的變化也不穩(wěn)定。因此,采用傳統(tǒng)方法鑒定有其局限性。隨分子生物技術(shù)發(fā)展,DNA序列已經(jīng)廣泛測序。通過對真菌保守變異序列測序,可進行菌種鑒定。目前常用的有18S rDNA和ITS。通過PCR擴增,測序,與GenBank中的已知序列進行比對后,判定真菌種類,將真菌劃分到屬或種。
我司提供擴增真菌18S rRNA序列,約1,700 bp,或ITS,大概在300-700bp,進行擴增,測序,BLAST,對樣品進行鑒定。真菌的ITS (Internal Transcribed Space) 基因,包括ITS1及ITS2兩部分,進化速度快,具有多態(tài)性,適于對親緣關(guān)系較近的菌株進行區(qū)分鑒定。
服務(wù)要求:
1.樣品形式可以是新鮮菌液、斜面培養(yǎng)基、平面培養(yǎng)基或者提取好的DNA。
2.如果樣品為基因組DNA,DNA濃度>10ng/ul,體積大于20ul。
3.鑒定結(jié)果一般可以鑒定到種。個別菌種由于微生物數(shù)據(jù)庫相關(guān)數(shù)據(jù)缺乏,只能鑒定到屬。如遇這種情況,正常收費。
4.對于某些致病性菌體,請?zhí)崆罢f明。
服務(wù)基本流程
1.我司進行引物設(shè)計合成;
2. PCR擴增18S rDNA/ITS;
3. PCR產(chǎn)物純化;
4. 測序,序列比對分析。
服務(wù)報告內(nèi)容
實驗報告包括PCR產(chǎn)物照片、NCBI序列比對鑒定結(jié)果、測序報告、序列堿基圖;
注:對于鑒定的菌株,我們不做備份及保留,請送檢之前做好保種工作。
如何下單
1. 郵件咨詢下單:填寫實驗項目的信息后,發(fā)送至郵箱[email protected]。
2. 在線咨詢下單:點擊屏幕右側(cè)“在線咨詢”,或掃描二維碼添加微信,或撥打咨詢電話15810756989,我們會盡快安排工作人員與您聯(lián)系!