項目簡介

   細(xì)菌16S rDNA是細(xì)菌染色體上編碼16S rRNA的DNA序列，存在于所有細(xì)菌染色體基因中，其序列能夠顯示細(xì)菌間不同分類等級水平上的特異性，適用于細(xì)菌親緣關(guān)系的研究，并可作為測量細(xì)菌進(jìn)化和親緣關(guān)系的良好工具，同時可以利用可變區(qū)序列的差異對不同菌屬、菌種的細(xì)菌進(jìn)行分類鑒定。通過構(gòu)建細(xì)菌16S rDNA文庫、細(xì)菌16S rDNA序列的DGGE變性梯度凝膠電泳技術(shù)和RFLP限制性片段長度多態(tài)性技術(shù)均可以對某一特定環(huán)境中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和細(xì)菌多樣性進(jìn)行分析。 

細(xì)菌16S rDNA文庫構(gòu)建

   使用PCR方法擴增特定環(huán)境樣品中混合細(xì)菌16S rDNA，使用TA克隆方法構(gòu)建細(xì)菌16S rDNA文庫，挑選陽性克隆測定細(xì)菌16S rDNA部分序列，并與GenBank中已知序列進(jìn)行同源性比較，獲得特定環(huán)境中的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和細(xì)菌多樣性信息。 

RFLP限制性片段長度多態(tài)性

   RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism,限制片段長度多態(tài)性)，是用特異性引物對混合微生物群體DNA提取物進(jìn)行PCR擴增，然后用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切酶對擴增產(chǎn)物進(jìn)行消化，由于序列的差異，呈現(xiàn)酶切圖譜的 DNA多態(tài)性。該方法已被廣泛用于基因組遺傳圖譜構(gòu)建、基因定位以及生物進(jìn)化和分類的研究。T-RFLP技術(shù)依據(jù)細(xì)菌16S rRNA基因保守區(qū)設(shè)計通用引物，以待分析樣品DNA為模板進(jìn)行PCR擴增，所得到的PCR產(chǎn)物采用特定的的限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切。由于在細(xì)菌之間16S rRNA序列中核苷酸序列的差異，酶切后會產(chǎn)生很多不同長度的限制性片段。通過檢測分析這些酶切片段大小即可反應(yīng)微生物群落組成情況。

服務(wù)要求

  1.請?zhí)峁┗蚪MDNA、經(jīng)菌種分離后帶有單菌落的新鮮平板或斜面。
  2.基因組DNA的濃度≥10 ng/μl，總體積≥20 μl，且無明顯降解；平板或斜面應(yīng)長有分離的單菌落。
  3.革蘭氏陽性細(xì)菌或厭氧菌、放線菌等特殊菌株，請在服務(wù)委托書中加以說明。
  4.如您的樣品具有一定的致病性或有潛在的危險，請您提供樣本DNA。
  5.請您提供需要選擇哪些方法來進(jìn)行細(xì)菌多樣性的分析。

服務(wù)報告內(nèi)容

  我們提供給您DNA電泳檢測圖，需測序樣本的測序鋒圖，序列比對結(jié)果及完整的結(jié)果分析報告。

如何下單

1. 郵件咨詢下單：填寫實驗項目的信息后，發(fā)送至郵箱[email protected]。

2. 在線咨詢下單：點擊屏幕右側(cè)“在線咨詢”，或掃描二維碼添加微信，或撥打咨詢電話15810756989，我們會盡快安排工作人員與您聯(lián)系！